ФК Люботен е професионален футболен клуб от Скопие, Северна Македония. Основан е през 1925 г. и се състезава в Първа лига на Македония. Домашните си мачове тимът играе на Градския стадион, с капацитет от 1500 места.

Люботен е спечелил две шампионски титли в националния шампионат (1996, 2006) и една купа на Македония (2003). Участвал е няколко пъти в европейските клубни турнири, достигайки до втори квалификационен кръг на Лига Европа през сезон 2006/07.

В състава на Люботен са играли известни македонски играчи като Горан Пандев, Никола Груевски и Илие Найдоски.